Soru:
Hücrelere pipetleme hasarı
bobthejoe
2012-06-13 01:02:53 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Pipetlemeden kaynaklanan kesme gerilmesinin potansiyel olarak ne kadar hasar verdiğini merak ediyorum. Kök hücre enjeksiyonu için kullanılan şırıngaların çok fazla hasara neden olabileceğini biliyorum. Ancak, P20 ve P200 pipet uçlarında bu ne ölçüde oluyor? Anlaşılır bir şekilde, bakteri hücrelerinin kayma modülü, kök hücrelerinkinden farklı olacak olan kanser hücrelerinden önemli ölçüde farklıdır.

P200 ile P20'yi ucuza karşılaştırmak mümkün olabilir (HeLa veya E. coli üzerinde kitle kaynaklı bir deneyi isteyen var mı?), Ancak gerçek sorunun mutlak sayılar istediğinden şüpheleniyorum ve bu nedenle cevaplamak neredeyse imkansız. % 100 canlı hücreler vermek için pipetsiz herhangi bir yöntemi tasavvur etmek zordur ve alternatifleri düşünmek daha da zordur (pipetlemeden sonra serbest DNA'yı ölçün? Bu, hücre sayımlarına nasıl dönüştürülebilir?). User137, iyi bir şey önerir, ancak yine de mutlak değildir. Kanıt yoksa, alacağınız tüm cevaplar spekülatif "uzman görüşü" olacaktır.
Yedi yanıtlar:
rhill45
2014-08-30 11:36:43 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Bu harika bir soru, yaklaşık 12 yıldır insanları kültür hücreleri konusunda eğitiyorum ve öğrenciler bunu anlamakta ve önemini takdir etmekte zorlanıyorlar vb.

Pipetleme sırasında hücrelerin genellikle deneyimlediği şey bir binanın kapısından içeri girmeye çalışan insan kalabalığına benzer. Pipetleme sırasında kesme, hücre kültüründe kesinlikle meşru bir sorundur. Çözülmeyi takiben dondurucu ortamda (DMSO içeren) hücreleri pipetlerken canlılık üzerindeki olumsuz etkisini en açık şekilde fark edeceksiniz. DMSO konsantrasyonları düşene kadar zarları zayıf & daha akışkan. Bu nedenle, bu noktada özellikle nazik olmak için, dondurulmuş hücreleri damla damla taze ortama pipetliyorsunuz.

Yukarıda belirtilen TOP10 hücreleri gibi prokaryotik hücreler, esasen şu özelliklere sahip olan Kalsiyum klorür ve gliserol ile işlenir. duvarları ve zarları üzerinde aynı etki. Bu nedenle pipetleme, bu hücreler çözüldükten sonra da dikkatlice yapılmalıdır.

Bununla birlikte, prokaryotik ve ökaryotik hücrelerin makaslamaya duyarlılığını karşılaştırırsanız, ökaryotik hücreler çok daha hassastır.

Alt klonlama ve diğer işlemler için yetkin bakteri kullanan kişiler için rutin kullanımlar, hücrelerinizin küçük bir yüzdesini öldürmek o kadar da önemli değil. Bununla birlikte, cDNA kitaplıkları oluşturmak için dönüşümü kullanıyorsanız, kitaplığın oluşturulduğu transkriptomu yeterince temsil eden bir titere sahip olmanız çok önemlidir.

Bu gibi durumlarda, daha kaliteli, yetkin bir hücre kullanıldığında, doğru sıcaklıklara bağlı kalmak ve pipetlemeyi en aza indirmek çok önemlidir. Bu nedenle, birçok kişiye DNA'yı daha sert bir alternatif olan, yukarı ve aşağı pipetleme yerine, yetkin hücrelerle döndürmeleri öğretilir.

Hücresel kesmeye katkıda bulunan en önemli dört faktör şunlardır: En çok katkıda bulunan veya en az katkıyı sağlayan sipariş formu:

  1. Pipet ucundaki deliğin çapı, ne kadar küçükse o kadar fazla kesme.
  2. Süspansiyonun ucun açıklığından geçme hızı. Ne kadar hızlı olursa o kadar çok zarar verir.
  3. Hücrenin boyutu ve sertliği. Daha büyük hücreler hasara daha yatkındır. Murein duvarlı hücreler hasara daha az eğilimlidir.
  4. Hücrelerin konsantrasyonu. Daha konsantre kültürler, zarar görmeye daha yatkındır.

Hücrenin kendisi hasar miktarı üzerinde bu kadar etkili ise ve hücre çeşitliliğinin çok fazla olması nedeniyle makyaj; Hasarı değerlendirmek için temsili bir deney tasarlamak çok zor ve zahmetli olacaktır.

Son olarak, çeşitli ipuçları ve seriolojik bilgiler de çok büyük. Bununla birlikte, eğer biri bunu değerlendirmeye çalışırsa, yapılabilir:

Temsili bir hücre dizisi seçin, temsili bir pipet çeşidi seçin. Kademeli olarak atanan hızları ve basınçları değerlendirebilmek için muhtemelen robotik bir pipet kullanmak isteyecektir. Farklı kültür konsantrasyonlarına, büyüme eğrisinin aşamalarına, pipetleme ile analiz arasındaki süreye, çıkan sıvı ile kültür arasındaki mesafeye vb. Bakın.

Çok başarılı bir analiz yönteminin propidyum iyodür ve FACS.

Çok fazla zamana ve dolara mal olacak deneyinizden sonra, sağduyu kurallarını bulacağınızı düşünüyorum: pipetlemeyi minimumda tutun ve mümkün olduğunda daha geniş ipuçları kullanın.

Bu iyi bir açıklamadır, ancak paletlemenin neden olduğu zarar olmayan ölüm yüzdesinin sayısal bir temsilini aslında vermez.
İyi nokta Burada, oldukça fazla sayıda oy alıyor gibi göründüğünü yeniden ifade edeceğim
Pipetin yapıldığı malzeme hücreyi de etkilemez mi? Farklı malzemelere farklı afiniteye sahip hücre zarlarının
@CRags kesinlikle evet ama gerçekten çok az.
Artem
2012-06-13 01:11:37 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Yapması kolay bir deney. Hücrelerinizi 10 mikrofüj tüpüne bölüntüleyin ve her süspansiyonu artan miktarda pipetleyin, tripan mavisi ile boyayın ve sayın.

En önemli faktörler hangi pipet tipini kullandığınız olacaktır; Bir p1000'in, sıvının hızı nedeniyle bir p200'den daha fazla hasara neden olmasını beklerdim. Ayrıca en önemli faktör bilim adamının becerisi olacaktır, yavaş pipetleme yaparsanız, hızlı pipetlemenin aksine stresi azaltacaktır.

Benim tecrübelerime göre pipet tipine ve operatörün becerisine bağlıdır . Bunu sizin için yanıtlamanın tek yolu, onu deneysel olarak denemektir.

Öyleyse, bu büyük ölçüde operatör hatasına dayanacaktır. Anekdot olarak, bunun tam tersi olduğunu duydum; P1000, P20'den daha az hasara neden olur.
Artem haklı: Söylemenin tek yolu ampiriktir. P1000, hız nedeniyle muhtemelen hücre hasarını etkileyecektir. Aksine, P200 ve P20, dar uç deliği nedeniyle bir miktar hasar verebilir.
Bir deneyin ve sonuçları gönderin. Operatör becerisinin en önemli faktör olduğuna inanıyorum.
HepG2 hücrelerini 384 ve 1536 plakalara plakalamak için peristaltik bir pompa kullanırdık. Birincil hepatositlere geçtiğimizde, pompa çok fazla öldürdü ve 8 kanallı bir pipetle elle kaplamaya geçmek zorunda kaldı. Yani hücre türü çok önemlidir.
Hayır, bu doğruyu ölçmeyecek .... sadece hayır
Ben
2012-06-13 01:13:26 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Anekdot olarak E pipetlenirken herhangi bir hücre ölümü gözlemlemedim. E. coli DH5alpha veya TOP10, ancak yetkin hücreler olarak, risk altındaki hücre duvarı nedeniyle yukarı ve aşağı pipetleme yoluyla karıştırılması önerilmez.

İyi nokta: Bakterileri mekanik olarak öldürmek oldukça zordur, yetkin hücreler daha hassastır ve cDNA kitaplıkları oluştururken çoğunlukla temsili sayıda koloniye ihtiyaç duyduğunuz için endişe gelir.
Bu güzel bir gözlem.
user1357
2014-08-31 08:07:45 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Bu soru fizikte veya kimyada daha iyi işlenebilir. Akışkanlar dinamiğinin fizikten farklı bir yöntemle tanımlanabileceği genel bir mühendisliğimiz olduğunu sanmıyorum, ancak yaptıysak orada da cevaplanmalı.

Aslında ozmotik veya sıvı basıncı kendi içinde değişikliklere neden olabilir ve muhtemelen hücreye zarar verebilir. Sonra kimyasal ya da sürtünme yanması gibi etki gücüne bağlı olarak kimyasallara verilen diğer eeksotermik ve endotermik reaksiyonlar.

Eminim yarı tehlikeli bir şekilde görmezden geldiğim diğer enerji korunumu gereksinimleri.

Genel olarak kayma gerilimine odaklanan bu ilginç makaleyi buldum.

Pipetleme, preimplantasyon embriyolarında kayma gerilimine ve fosforile stresle aktive olan protein kinaz / jun kinazın yükselmesine neden olur.

Xie Y1, Wang F, Puscheck EE, Rappolee DA.

1.2 din / cm (2) 'deki kesme gerilimi, embriyolarda apoptozdan önce gelen ve buna neden olan stresle aktive olan protein kinaz / jun kinaz fosforilasyonunu indükler (Xie ve diğerleri, 2006b, Biol Reprod). Embriyoların pipetlenmesi, in vitro fertilizasyondan embriyoların toplanmasına kadar, gen ekspresyonunu mikrodizilerle analiz etmeden önce birçok protokol için gereklidir. Pipetlemenin fosforile edilmiş MAPK8 / 9'u (daha önce stresle aktive olan protein kinaz / jun kinaz / SAPK / JNK1, 2 olarak biliniyordu) yukarı regüle edip etmediğini belirlemeye çalıştık. MAPK8 / 9 aktivasyonunun bir belirteci olan fosforile edilmiş MAPK8 / 9'un pipetleme ile doza bağımlı bir şekilde yukarı regüle edildiğini bulduk. Zona pellucida çıkarılmış embriyolar, 1.2 din / cm (2) kesme kuvvetinin aracılık ettiği stres kaynaklı öldürücülüğe karşı daha duyarlıyken, E4.5'te yumurtadan çıkmış embriyolarda daha düşük pipet tritürasyonlarında fosforile MAPK8 / 9 indüklenmiştir. E4.5 embriyoları, E2.5 veya E3.5'te yumurtadan çıkmamış embriyolara göre MAPK8 / 9 indüksiyonuna daha duyarlıydı. E3.5 embriyoları ayrıca, birçok hücre tipinde kayma stresinin bir belirteci olan FOS proteininin (önceden c-fos olarak biliniyordu) pipetleme doza bağlı bir indüksiyonunu gösterdi. E1.5'ten E4.5'e ex vivo embriyolarda ölçülen fosforile MAPK8 / 9, düşük seviyelerde eksprese edildi. Fosforile MAPK8 / 9 ve FOS'u indüklemek için yeterince pipetlenen embriyolar, 24 saat sonra işlenmemiş embriyolarla aynı sayıda hücreye sahipti. Bu, MAPK8 / 9'un geçici kesme stresine bağlı hızlı fosforilasyonunun uzun vadeli negatif biyolojik sonuçlara aracılık etmediğini gösterir. Ancak, çoklu işleme olayları gerektiren tekniklerin MAPK8 / 9'u indüklemesi ve biyolojik sonuçlara neden olması veya diğer biyolojik sonuçların düşük miktarlarda geçici kesme geriliminden etkilenmesi mümkündür. Bu çalışma, sinyal transdüksiyon fosfoproteinlerinin, proteinlerinin ve mRNA'nın deneysel ölçümünden önce embriyo işlemenin dikkatle yapılması gerektiğini göstermektedir. Gerçekten de, kayma geriliminin yüzlerce protein ve mRNA'da hızlı geçici değişikliklere neden olması muhtemeldir.

@rhill45 evet soru, pipetleme sırasında hücre kayma gerilimi hasarı hakkındaydı ... diğer yanıt, dost ucundan gelen tek hasarı satın alıyor gibi görünüyordu ... ama pipetlenen sıvının kayma geriliminin eşit derecede zarar verme olasılığının olduğunu belirtmek istedim / hücreyi yok et.
@rhill45 ayrıca eğer php öğrenecekseniz asp için zaman harcamalısınız çünkü birçok endüstri ikisi arasında gördüğünü görüyor.
inf3rno
2014-10-23 06:49:27 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Bu küçük boyutlarda kayma gerilmesi $ \ tau $ genellikle dyne / cm2 veya N / m2 = Pa cinsinden ölçülür. Aralarındaki denklemler: $ 1dyn / cm ^ 2 = 10 ^ {- 5} N / cm ^ 2 = 0.1N / m ^ 2 = 0.1Pa $.

Pipetleme zigotlara ne tür zararlar verebilir?

Taramalı elektron mikroskobu kullanarak, üzerinde açık delikler bulduk. parçalanmış yumurtaların yüzeyi, mikroenjeksiyondan sonra plazma zarının yeniden kapanamadığını gösterir. Bölünmemiş yumurtalarda delik görülmedi, ancak çoğunda iyileşmiş delikleri düşündüren zar değişiklikleri vardı.

1.2 dyn / cm2'lik küçük bir kesme gerilimi bile zigotları pipetleyerek apoptozu indükler. Dolayısıyla, zigotların kritik kayma gerilmesi seviyeleri 1,2 din / cm2'dir ve pipetleme 1,2 din / cm2'den daha büyük kuvvetler içerir.

1,2 din / cm2'de kesme gerilimi, stresle aktive olan protein kinaz / jun kinazı indükler embriyolarda apoptozdan önce gelen ve buna neden olan fosforilasyon (Xie ve diğerleri, 2006b, Biol Reprod). Embriyoların pipetlenmesi, in vitro fertilizasyondan embriyoların toplanmasına kadar, gen ekspresyonunu mikrodizilerle analiz etmeden önce birçok protokol için gereklidir. Pipetlemenin fosforile edilmiş MAPK8 / 9'u (daha önce stresle aktive olan protein kinaz / jun kinaz / SAPK / JNK1, 2 olarak biliniyordu) yukarı regüle edip etmediğini belirlemeye çalıştık. MAPK8 / 9 aktivasyonunun bir belirteci olan fosforile MAPK8 / 9'un pipetleme ile doza bağlı bir şekilde yukarı regüle edildiğini bulduk.

Kritik kayma gerilmesi seviyesi, hücre türüne ve türüne bağlı olarak hayvan hücreleri tarafından 0,01 ile 1000 din / cm2 arasındadır. (Sanırım ortalama 50 dyn / cm2 civarında, ancak kritik kesme seviyelerinden ve en ölümcül kesme seviyelerinden bahseden makaleler arasında ayrım yapmak çok zor, bu nedenle aralık ve ortalama daha düşük olabilir.) Ölüm sabiti (1 / h ), kayma gerilimini artırarak üssel olarak artar.

Kayma geriliminin yapışık BHK hücreleri üzerindeki etkisinin ayrıntılı incelenmesi için bir aparat geliştirildi. 0,0 ile 2,5 N m 2 arasındaki kesme kuvvetleri incelenmiştir. Hücre canlılığı, hücre morfolojisi, hücre lizizi ve hücre boyutu üzerindeki etki belirlendi. Artan kesme kuvvetleri ve artan maruz kalma süresi, hücre morfolojisinde ve hücre ölümünde artan değişikliklere neden oldu. Bir "kritik kayma gerilmesi seviyesi" belirlendi.

Bir fare hibridomasına yönelik kesme gerilimi ile ilgili hasar, koaksiyel silindirli Searle viskozimetrede laminer ve türbülanslı koşullar altında Abu-Reesh ve Kargi tarafından incelendi. Hücreler, 0.5 ila 3.0 saat süreyle 5 ila 100 N / m2 kayma gerilmesi seviyelerine maruz bırakıldı. Belirli bir kesme gerilimi ve maruz kalma süresinde, türbülanslı kesme, geçmişte protozoa ve bitki hücreleri için de bildirildiği gibi, laminer kesmeden çok daha fazla zarar vericiydi. Türbülanslı koşullar altında, kesme gerilimi 5 N / m2'yi aştığında hasar meydana geldi. Hücrelerin solunum aktivitesi, hücre zarından daha önce hasar gördü, bu da stres sinyalinin hücrenin içine iletildiğini gösteriyor. Hücre hasarı, hem laminer hem de türbülanslı ortamlarda birinci dereceden kinetiği takip etti. 5 ila 30 N / m2 türbülanslı kayma gerilmesi seviyeleri için, ölüm oranı sabiti (kd) artan gerilim seviyesi ile üssel olarak artmıştır; kd değerleri 0,1 ile 1,0 1 / sa arasında değişiyordu.

Sürekli olarak 1-5 din / cm2 kayma proliferasyonuna maruz kalan alt konfluent endotel kültürleri, aşağıdakilere benzer bir hızda statik kültürlerinki ve aynı doygunluk yoğunluğuna ulaşır (– 1.0-1.5 × 105 hücre / cm2). 5-10 din / cm2'lik bir laminer kayma gerilimine maruz kaldıklarında, birleşik tek tabakalar, hücre şeklinde çokgenden elipsoide doğru zamana bağlı bir değişikliğe uğrar ve akışla tekdüze bir şekilde yönlendirilir. Birbirine karışan tek tabakadaki doğrusal "yaraların" rejenerasyonu, uygulanan kuvvetin yönünden etkileniyor gibi görünmektedir. Ön çalışmalar, sıvı endositoz, sitoskeletal montaj ve trombojenik olmayan yüzey özellikleri dahil olmak üzere belirli endotel hücre fonksiyonlarının da kayma stresine duyarlı olduğunu göstermektedir. Bu gözlemler, sıvı mekanik kuvvetlerin endotel hücre yapısını ve işlevini doğrudan etkileyebileceğini göstermektedir.

0.25 dyne / cm (2) üzerindeki kayma stresi, 20 saat sonra proksimal tübüler epitel hücrelerinde (LLC-PK (1) hücreler) değil, podositlerde dramatik kayıpla sonuçlandı.

Bir dizi dikkatli rotasyonel bir viskozimetrede kan hasarı konusunda çalışmalar yapılmıştır. Katı yüzey etkileşimi, merkezkaç kuvveti, hava arayüzü etkileşimi, kesilmiş ve kesilmemiş katmanların karıştırılması, hücre-hücre etkileşimi ve viskoz ısınmanın etkilerine özel önem verilmiştir. Sonuçlar, 1500 din / cm2'lik bir eşik kayma gerilimi olduğunu, bunun üstündeki kapsamlı hücre hasarının doğrudan kayma gerilimine bağlı olduğunu ve yukarıda listelenen çeşitli ikincil etkilerin ihmal edilebilir olduğunu göstermektedir.

Bazı dinoflagellatların (mikroalg) kayma gerilmesi eşiği, eritrositlerinkinden (0.029 N / m2) bile daha düşüktür. Örneğin, yalnızca 0,0044 N / m2'lik (2,2 1 / s'lik bir kesme hızına eşdeğer) sürekli bir laminer kesme gerilmesi seviyesinin dinoflagellat Gonyaulax polyedra için ölümcül olduğu kanıtlanmıştır.

Diğer hücre tipleri, hayvan hücreleri kadar hassas gerekli değildir ve apoptozla (yaklaşık 10 dyn / cm2) kesilmek üzere reaksiyona girmeleri gerekmez. stres, bu yüzden onları yok etmek için nekrotik (yaklaşık 5000 dyn / cm2) kuvvetler kullanmanız gerekir:

  hücre tipi boyutu kayma hassasiyeti mikrobik hücreler 1-10μm düşük mikrobiyal peletler / kümeler 1 cm'ye kadar orta bitki hücreleri 100μm orta / yüksek bitki hücresi, mikro taşıyıcılarda 1-2 cm yüksekliğe kadar yüksek hayvan hücreleri 20μm yüksek hayvan hücreleri toplar 80-200μm çok yüksek mantarlı hücreler 2-10μm orta / yüksek  

Sonuçlar, Çin Hamster Yumurtalıklarının ve İnsan Embriyonik Böbrek hücrelerinin, salınımlı, genişlemeli akışta düşük seviyelerde hidrodinamik strese (yaklaşık 2.0 Pa) maruz kaldıklarında apoptotik yola gireceğini göstermektedir. Buna karşılık, hücreler maruz kaldığında nekrotik ölüm hüküm sürer. basit kayma akışında 1.0 Pa civarında veya genişleme akışında 500 Pa civarında hidrodinamik gerilmeler.

Kayma hassasiyeti yalnızca hücre tipine ve türüne göre belirlenmez, ilgili başka birçok faktör vardır:

  • hücre türü ve tür
  • mevcut olduğunda hücre duvarının bileşimi ve kalınlığı
  • hücrenin boyutu ve morfolojisi
  • ister türbülanslı ister laminer veya arayüzlerle ilişkili olsun, kayma geriliminin yoğunluğu ve yapısı (ör. balonun yükselmesi ve kopması sırasında)
  • büyüme geçmişi, hem kısa vadeli (ör. açlık) hem de uzun vadeli adaptasyon
  • büyüme ortamı (eser elementler, vitaminler, karbon ve nitrojen kaynakları)
  • büyüme oranı
  • büyüme aşaması
  • varsa kesme koruyucu ajanların türü ve konsantrasyonu

Hücreler kesilmeye karşı çok hassas olabilir türbülanslı akışın neden olduğu stres

Laminer akış viskometrisi ölçümleri temelinde, Morindata citrifolia hücreleri için 80-200 N / m2'lik kritik bir kesme gerilimi seviyesi önerilmiştir.

... Daucus carota için 50 N / m2 kayma gerilimi seviyesi hücre hasarıyla ilişkilendirilmiştir. Başka bir çalışmada, laminer akışlı Couette viskozimetresindeki havuç hücreleri, 0.5-100 N / m2 kayma gerilimi aralığında büyüme ve bölünme yeteneğini kaybetti. Hücre içi enzim aktivitesi, 3000N / m2'nin üzerindeki kayma gerilmesi seviyelerinde bozulmuş, ancak 10.000 N / m2'lik bir kayma gerilmesi seviyesi uzun bir perioud (> 1 saat) uygulanana kadar önemli bir parçalanma gerçekleşmemiştir.

Aksine laminer akıştaki davranışa göre, hücreler türbülanslı çark çalkalamasına oldukça duyarlıydı. Pervane ucu hızları ~ 1,1 m / s, hücrelerin önemli bir bölümünü 40 dakika içinde parçaladı.

Kabarcığın ara yüzüne hücre yapışması ve ilgili güçlü kuvvetler (karıştırılan biyoreaktörler tarafından> 1000 din / cm2) nedeniyle kabarcık hasarı ciddidir (tek bir 3,5 mm boyutunda balonla 1000 hücre). Yapışma ve dolayısıyla hasar yüzey aktif maddelerle azaltılabilir.

Hücrelerin bir yırtılma balonuna bağlandığı veya çok yakın olduğu durumlarda hidrodinamik kuvvetlerin rüptür ile ilişkili hücreler hücreleri öldürmek için yeterlidir.

Tüm deneyler Spodoptera frugiperda (SF-9) böcek hücreleri ile, Pluronic F-68 ile ve olmadan TNM-FH ve SFML ortamında gerçekleştirildi. Deneyler, TNM-FH ortamında tek, 3.5 mm'lik kabarcık kopması başına yaklaşık 1050 hücrenin öldüğünü ve yukarı doğru jette yaklaşık olarak aynı sayıda ölü hücrenin bulunduğunu göstermektedir. Bu yukarı doğru jetteki hücre konsantrasyonunun Pluronic F-68 içermeyen TNM-FH ortamındaki hücre süspansiyonundan iki kat daha yüksek olduğu da gözlendi. Bu daha yüksek konsantrasyonun, hücrelerin kabarcık arayüzüne yapışmasının bir sonucu olduğuna inanılmaktadır. Bu hücreler, kabarcık kırılma işlemi sırasında yukarı doğru jete doğru süpürülür. Son olarak, bu emilen hücreleri içeren balonun etrafındaki ince bir tabakanın, diğer araştırmacılar tarafından sunulan "varsayımsal öldürme hacmi" olduğu öne sürülmüştür.

Bir hibridoma hattı için, havasız akışta laminer kayma gerilimine (208 N / m2) maruz kalmanın bir koni ve plaka viskozimetre, hücre sayısında ve 20 dakika içinde canlılıkta önemli bir kayba yol açtı. Sabit 180 s maruziyette, kesme gerilimini 100-350 N / m2'nin üzerine çıkarır 350 N / m2 stres seviyesinde hücrelerin>% 90'ının yok edilmesiyle doğrusal olarak geliştirilmiş hücre bozulması. Bir biyoreaktör yüzeyindeki kabarcık kopmasıyla ilişkili kayma gerilmesi seviyeleri 100-300 N / m2'nin üzerinde değişebilir. Bu değerler, havalandırılmamış laminer akış deneylerinde hibridomalara zarar veren kayma hızlarıyla oldukça tutarlıdır.

Daha küçük delikli pipetler daha fazla hasara neden olur.

Ayrıca enjeksiyon pipetlerinin boyutu ve zigot çapına göre konikliği, olası toksisite gibi gen transfer prosedürünün hayatta kalmasını etkileyebilecek yönlerini de inceledik. enjeksiyon ortamı, enjeksiyonun zamanlaması ve pipetin hemen veya gecikmeli çekilmesi. Hücre canlılığını önemli ölçüde etkileyen tek faktör, pipet boyutu ve incelmesi ve ilk bölünmeye göre enjeksiyonun zamanlamasıydı. Bu, zigot canlılığının enjeksiyon pipetinin ürettiği deliğin boyutuyla ters orantılı olduğunu ve döllenmiş yumurtanın kendisini bölünmeye hazırlandıkça zara verilen hasarın daha az başarılı bir şekilde tamir edildiğini göstermektedir.

Pipetleme ile kesme gerilimi seviyesi hakkında bir şey bulmak zor. Kesinlikle 1 dyn / cm2'den fazla olabilir. Kısa bir süresi vardır (en fazla birkaç saniye). Aşağıdaki faktörlerin pipetleme yoluyla kayma gerilimi seviyelerini etkileyebileceğini düşünüyorum:

Muhtemelen daha fazla faktör söz konusudur, ancak ben bir pipetleme uzmanı değilim. ;-) Diğerleriyle aynı fikirdeyim, kesinlikle kişisel becerilere bağlı. bir amatör pipetleme yoluyla büyük baloncuklar oluşturabilir, bu da birçok hücreyi oluşum ve bozulma yoluyla öldürebilir ...

Artem'e katılıyorum, özellikle sonuç sizin için önemliyse, bunun yapılması gereken bir deney. Pipet hasarı hakkında bir model oluşturmak için ihtiyacınız olan şey, pipetleme ile kesme gerilimi seviyeleri ve hücrelerin kritik kesme gerilimi seviyeleridir. Pipetlerinizdeki kayma gerilimi seviyelerini ölçebileceğiniz ve bildiğim kadarıyla pipetleme için bir akış modelinin bulunmadığı, bu nedenle bir tez veya diploma çalışması için iyi bir konu olabileceği bir tasarım ve deney yapmanın zor olduğunu düşünüyorum.

Adam McInnes
2017-01-10 07:53:25 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Bunun iki yıllık bir konu olduğunu biliyorum, ancak yine de bu akşamki gibi başka birinin bu yanıtı araması durumunda bunu yayınlayacaktım. Aşağıda alıntı yapılan bu makale, pipet uçları ile iğneleri özel olarak tartışmamaktadır, ancak inceltme ile silindirik iğnelerin hücre hasarı üzerindeki etkilerindeki farkı tartışmaktadır. Ne yazık ki, kağıttaki matematik beni biraz aşıyor (ben bir doktorum, mühendis değilim ve bu tür şeyleri tıp fakültesinde ele almadılar), ancak silindirik iğnelerin miktarının yaklaşık 5 katı ile sonuçlandığını buldular. herhangi bir akış hızında sivriltilmiş bir iğneye kıyasla hücre ölümü ve hasar gören hücre miktarının yaklaşık 6-8 katı. Bunun nedeni, kısmen, konik iğnelere kıyasla silindirik iğnelerde akış oranlarını artırmak için daha yüksek basınçlara duyulan ihtiyaç ve geometrilere bağlı olarak kesme varyasyonlarından kaynaklanıyordu. Konik bir iğne plastik bir pipet ucuyla aynı olmasa da, geometriler karşılaştırılabilir.

Biotechnol Prog. 2011 Kasım-Aralık; 27 (6): 1777-84. Dağıtım tabanlı biyofabrikasyon işleminde iğne geometrisinin akış hızı ve hücre hasarı üzerindeki etkisi. Li M1, Tian X, Schreyer DJ, Chen X.

http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/btpr.679/full

maca
2017-08-11 18:27:47 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Gerçek hayattaki biyolojik bir örneğim var. basitleştirilmiş deney düzeneği: ex vivo saflaştırılmış B hücreleri, PBS'de 3 yıkamaya (döndürme ve yeniden askıya alma) tabi tutulur, ardından in vitro olarak 24 saat inkübe edilir ve Acqua Zombie ve PI kullanılarak akış sitometrisi ile analiz edilir ölü hücre dışlanması için. Deney 1: 1 ml uç kullanarak yıkamalardan sonra pipetleme Deney 2: 10 ml pipet kullanarak yıkamalardan sonra pipetleme

Akış sitometrisi ile analiz edilen hücre canlılığı: Deney 1:% 9,96 Deney 2:% 43,9



Bu Soru-Cevap, otomatik olarak İngilizce dilinden çevrilmiştir.Orijinal içerik, dağıtıldığı cc by-sa 3.0 lisansı için teşekkür ettiğimiz stackexchange'ta mevcuttur.
Loading...